Становление советской судебной системы на Дальнем Востоке проходила в трудных условиях: во-первых, отсутствовал руководящий законодательный материал; во-вторых, не было достаточного количества судебных работников.

Постоянное руководство в создании судебного аппарата осуществляло Дальбюро ЦК ВКП(б) и Дальревком. Перед Дальревкомом была поставлена задача - подготовить кадры для судебного аппарата из рабочих и крестьян. Первыми на Дальнем Востоке юридические курсы (шестимесячные) были организованы в Чите.

Конструкция судебных органов бывшей Дальневосточной республики сохранялась до начала 1923 года, т.е. до момента введения в действие нового Закона о судоустройстве.

В 1923 году во всех шести губерниях Дальневосточной области создаются губернские суды.

К маю 1923 года при всех губернских судах области создаются:

1. трудовые сессии нарсудов;

2. нотариальные конторы;

3. бюро юридических консультаций;

4. коллегии защитников.

Для координации и руководства судебной деятельностью Дальневосточной области в мае 1923 года было образовано Дальневосточное отделение Верховного суда РСФСР, в непосредственном подчинении которого и находились все губернские суды области.

В ноябре 1923 года создается Дальневосточный областной дисциплинарный суд.

Дальневосточный краевой суд был организован 1 мая 1926 года. На основании Постановления Далькрайисполкома от 17 февраля 1932 года в состав Дальневосточного краевого суда на 1932 год были утверждены Председатель крайсуда, два заместителя, три члены Президиума, Председатель линейного суда, семь членов крайсуда, один из которых КУЗНИЦЫН Владимир Васильевич возглавлял народный суд Нагаево Магаданского района, который являлся отделением Дальневосточного краевого суда по СЕВВОСТЛАГУ НКВД и «ДС» и фактически являлся первым председателем в 1937 году на территории Магаданской области.

Начиная с июля 1930 года на Дальнем Востоке постепенно упразднялась окружное отделение, образовывались области.

В 1932 году в составе Дальневосточного края были образованы Приморская, Амурская, Камчатская и Сахалинская области. Карякский и Чукотский национальный округа образованы в октября 1930 года вошли в состав Камчатской области.

Хабаровская область образовалась в 1934 году. Районы Колымы оставались в непосредственном подчинении Далькрайисполкома Хабаровской области.

Краевому суду были подведомственны суды районов Колымы, которые являлись районами непосредственного подчинения Крайисполкому, такие как Ольский, Среднеканский и Северо- Эвенский.

В состав постоянной сессии Краевого суда при Дальлаге НКВД включались в основном бывшие члены Дальневосточного краевого суда, упраздненного в января 1939 года. В феврале 1939 года постоянная сессия Хабаровского краевого суда была организована в городе Комсомольске-на-Амуре, а в конце 1939 года в Магадане.

Всех членов постоянной сессии в городе Магадане призвали согласно приказу, в связи с призывом в кадры рабоче-крестьянской Красной Армии. Этим же приказом сессия в Магадане была ликвидирована.

В послевоенный период наряду с восстановлением народного хозяйства требовалась реорганизация судебной системы. Дела из подсудности военных трибуналов передавались народным судам. Это означало, что сеть судебных учреждений необходимо было увеличивать. Количество народных судов на Колыме увеличилось с семи до двенадцати.

Из Ольского, Среднеканского и Северо-Эвенского районов Хабаровского края, а также из отдельных районов Чукотского национального округа в 1953 году образована как самостоятельная область РСФСР - Магаданская область. В связи с этим постоянная выездная сессия краевого суда в Магадане была ликвидирована 12 января 1954 года.

Постановлением Совета Министров РСФСР от 3 мая 1954 года утверждена сеть народных судов: по два в Магадане, Ольском и Северо-Эвенском районах, по семь в Среднеканском районе и Чукотском национальном округе. В дальнейшем Указом Президиума Верховного Совета РСФСР от 19 апреля 1960 года было удовлетворено ходатайство исполнительных комитетов Чукотского окружного и Магаданского областного Советов депутатов трудящихся об упразднении окружного суда Чукотского национального округа - его функции были переданы Магаданскому областному суду.

Магаданский областной суд, действуя с февраля 1954 года в г. Магадане, в июне-июле 1954 года организовал постоянные сессии в поселках Усть-Омчуг, Ягодный, Сусуман, Эгвекинот.

В территориальную подведомственность Магаданскому областному суду, кроме Чукотского окружного суда, наряду с 11 судебными участками области, входило 3 судебных участка г. Магадана.

В период с июня 1955 по 1962 год были упразднены Постоянные сессии Магаданского областного суда. 18 декабря 1960 года состоялись выборы судей народных судов области и одновременно на территории Магаданской области и входившего в нее Чукотского национального округа были образованы городской и районные суды: Магаданский городской народный суд, Ольский, Тенькинский, Ягоднинский, Сусуманский, Анадырский, Иультинский, Чаунский, Восточно-Тундровский, Среднеканский, Северо-Эвенский, Омсукчанский, Беринговский, Чукотский и Провиденский районные народные суды. В марте 1967 года, в связи с образованием по Указу Президиума Верховного Совета РСФСР от 30 декабря 1966 года в составе Магаданской области был образован и начал действовать Хасынский районный народный суд.

Решением горисполкома от 19 декабря 1960 года и согласно приказу Магаданского областного суда от 24 декабря 1960 года № 119 в городе Магадане ликвидированы народные суды первого, второго и третьего участков и образован Магаданский городской народный суд. Председателем Магаданского городского народного суда с 19 декабря 1960 года назначен НАЗИН Иван Яковлевич.

Этим же приказом утверждено штатное замещение Магаданского городского суда: три суди - Анисимова Татьяна Григорьевна, Васильев Василий Венедиктович, Павлов Василий Иванович; три судебных исполнителя - Комалова Александра Григорьевна, Филоненко Серафима Даниловна, Зайцева Екатерина Михайловна, заведующей канцелярией являлась Дзюба Валентина Павловна, секретари суда - Антонова Тамара Васильевна, Овчинникова Нина Дмитриевна, секретари судебных заседаний - Кагирова Евдокия Гавриловна, Бабкова Надежда Ивановна, Далейко Любовь Михайловна, архивариус - Клокома Лидия Александровна, делопроизводители - Ушкова Нина Ивановна, Сапицкая Людмила Матвеевна, курьеры-уборщики - Вожакова Нина Юрьевна, Боровский Николай Петрович и Щурова Наталья Михайловна.

С принятием законов «О статусе судей Российской Федерации» от 26.06.1992 г. № 3132-1 и «О судебной системе Российской Федерации» от 31.12.1996 г. № 1-ФКЗ был придан статус федеральных всем народным судьям, а народные суды стали федеральными. Таким образом, Магаданский городской народный суд был переименован в Магаданский городской суд.

Районные (городские) суды - это первое звено федеральных судов общей юрисдикции. Каждый из них является вышестоящим судебным органом для мировых судей и осуществляет надзор за судебной деятельностью мировых судей.

С 01.06.2004 года, на основании распоряжения Судебного департамента при Верховном Суде Российской Федерации от 17 марта 2004 года № 30-р, в соответствии с приказом председателя Магаданского городского суда от 29.03.2004 года № 24 в Магаданском городском суде образовались структурные подразделения: общий отдел, отдел по обеспечению судопроизводства по гражданским делам, отдел по обеспечению судопроизводства по уголовным и административным делам, отдел судебной статистики, кодификации и систематизации законодательства и кадровой работы.